JDT には、ユーザーが Eclipse デフォルト・コード・フォーマッター・オプションまたはカスタム・オプションのどちらかにより Java ソース・コードをフォーマットできるようにするコマンド行 Eclipse アプリケーションがあります。
フォーマッター・アプリケーションの実行
CodeFormatter