Normál esetben a fejlesztőnek általában nem kell a vizuális szerkesztő példányok által használt virtuális géppel foglalkoznia. A tapasztalt felhasználók azonban beállíthatják a munkaterületet úgy, hogy a virtuális gép System.out illetve System.err kimenetére küldött üzenetek a munkaterület .metadata könyvtárában található .log fájlba kerüljenek.
A Java komponenseket futtató virtuális gép nem egyezik meg azzal, amelyikben a munkaterület fut. A vizuális szerkesztő minden egyes példányához külön virtuális gépjön létre. A virtuális gépek osztályútvonala a Java projekt összeépítési útvonalának bejegyzéseit tartalmazza. Ha a Java összeépítési útvonal módosul, akkor a változások életbe léptetéséhez be kell zárni, majd újra kell indítani a megnyitott vizuális szerkesztő példányokat.
A munkaterület indításakor a felhasználó megadhatja a -DEBUG kapcsolót egy szöveges elérési útjával:
-DEBUG file:/c:/temp/options.txt
Ez a hibakeresési fájl, amelynek bejegyzéseit a vizuális szerkesztő beolvassa. Ha a fájl tartalmazza az alábbi sort, akkor a System.out vagy System.err folyamra küldött üzenetek a konzolon jelennek meg:
org.eclipse.jem.proxy/remote/debug/vmtraceout=true
A vizuális szerkesztő által használt VM üzeneteinek konzolos megjelenítésén kívül hibakeresési üzemmódban is elindíthatja a virtuális gépet, és távoli hibakeresést hajthat végre. Ez a művelet azonban nincs optimalizálva, és a vizuális szerkesztő későbbi változataiban valószínűleg meg fog változni. Mindazonáltal a funkció dokumentált és rendelkezésre áll arra az esetre, ha szükség lenne a Java komponensek hibakeresésére tervezési időben. A távoli hibakereséshez két munkaterület szükséges: egy a Java komponensek, egy másik pedig a socket alapú távoli hibakeresés futtatásához. A második munkaterület lehet futhat ugyanazon, vagy egy másik gépen is. A vizuális szerkesztő virtuális gépének hibakereséséhez a -DEBUG kapcsolóval megadott fájlnak tartalmaznia kell az alábbi sort:
org.eclipse.jem.proxy/remote/debug/debugvm=true
Amikor a vizuális szerkesztő elindít egy virtuális gépet, rákérdez, hogy kívánja-e hibakeresés módban indítani azt.
Az előző párbeszédablakot a Teszt projekt HelloFrame.java osztályának megnyitásakor jeleníti meg a vizuális szerkesztő. Ha az Igen gombra kattint, vagy a konzolon megnyomja az I billentyűt majd az Entert, akkor a virtuális gép az -Xdebug kapcsolóval felfüggesztett módban indul egy socket kapcsolattal. Egy szabad port kerül lefoglalásra. Majd a rendszer közli a felhasználóval a számát.
A következő lépés egy távoli hibakereső csatlakoztatása a 7078-as portra. A vizuális szerkesztőt futtató munkaterület példány a távoli hibakereső csatlakoztatása alatt felfüggesztésre kerül, ezért egy másik alkalmazásból kell használnia a hibakeresést. Ha a másik alkalmazás a munkaterület egy további példánya, akkor a hibakeresést elkezdheti a menüpont Hibakeresés > Hibakeresés elemével és létrehozhat egy Távoli Java alkalmazás konfigurációt.
Adja meg az stdout kimenetre írt portszámot, esetünkben a 7078 értéket. Ha a hibakereső másik gépen található, akkor a Hoszt mezőben adja meg a hibakeresni kívánt munkaterületet futtató számítógép IP címét. A távoli hibakeresés elindításához kattintson a Hibakeresés gombra, majd a hibakeresés alatt álló munkaterülethez tartozó stdin konzolon nyomja meg az I billentyűt.
A vizuális szerkesztő példányok által használt virtuális gép hibakeresésén kívül a projekt a hibakeresését is meg kell erősítenie:
Kívánja hibakeresés módban indítani a távoli virtuális gépet (Projekt (Teszt)- Beaninfo)? (Nyomja meg a 'I' vagy a 'N' billentyűt):
Ez a belső elemzést végző illetve a java.beans.Introspector-t futtató virtuális gépre vonatkozik, ami úgy különböztethető a vizuális szerkesztő virtuális gépétől, hogy ez nem határozza meg egy adott Java forrásfájl nevét. Ez a virtuális gép akkor indul, amikor első ízben van szükség egy Java komponens BeanInfo információira a projekten belül, és mindaddig aktív marad, amíg a felhasználó a projektet be nem zárja. A projekt hibakeresésével keresztüllépkedhet és kielemezheti a BeanInfo osztályokban található, a Java komponensek belső elemzése során lefutó kódot. Egy Java komponensosztály belső elemzése a komponens projekten belüli első használatakor fut le. A teljesítmény javítása érdekében az eredmény a gyorsítótárba kerül. Ha bármikor szükség lenne a BeanInfoinformation információkat tartalmazó gyorsítótár törlésére, akkor zárja be majd nyissa meg újra a projektet az előugró menüjének bezárás illetve megnyitás menüpontjával.