Aby możliwa była obsługa różnych serwerów aplikacji J2EE, narzędzia J2EE umożliwiają określenie konkretnego serwera docelowego przy opracowywaniu projektu aplikacji korporacyjnej (EAR). Aby możliwe było prawidłowe wdrożenie aplikacji WWW na serwerze, w większości przypadków serwer docelowy musi być taki sam dla projektu WWW i projektu EAR.
Po utworzeniu projektu WWW można zmodyfikować serwer docelowy przy użyciu okna dialogowego właściwości projektu. Aby to zrobić, należy kliknąć projekt prawym przyciskiem myszy w widoku Eksplorator projektów, a następnie wybrać opcje
.