Vous pouvez déboguer un projet Java SQLJ de la même façon qu'un projet Java normal.
Pour déboguer directement à partir d'un fichier SQLJ, la préférence Activer le débogage à partir d'un fichier SQLJ doit être activée dans les préférences SQLJ. Cette préférence est activée par défaut. Si cette préférence n'est pas activée, les points de rupture que vous fixez dans un fichier SQLJ ne fonctionneront pas car le débogage survient dans les fichiers Java générés par le traducteur SQLJ. Vous devez créer un nouveau projet pour que les modifications de cette préférence prennent effet.