Se sono presenti elementi, attributi, entità, notazioni e commenti non più necessari, è possibile eliminarli.
Le seguenti istruzioni sono state scritte per la prospettiva Risorsa, ma queste funzionano in molte altre prospettive.
Per eliminare un elemento, un attributo, un'entità, una notazione o un commento:
È possibile "annullare" l'eliminazione di un elemento. Per fare ciò, fare clic con il pulsante destro del mouse su tutti gli elementi, gli attributi, le entità, le notazioni o i commenti e fare clic su Annulla eliminazione. È necessario eseguire questa operazione prima di chiudere l'editor, altrimenti, le voci non esistono più sul sistema e si dovrà ricrearle nuovamente se le si desidera.
L'editor della DTD ha un meccanismo integrato per gestire gli elementi di integrità di riferimento. Quando si elimina o si ridenominano determinati nodi, si verifica una pulizia automatica.