Zu den Aufgaben des Systemadministrators von WebSphere Message Broker gehören die Anpassung und Konfiguration, die Ausführung von Dienstprogrammen sowie die Durchführung der Fehlerbestimmung und Erfassung von Diagnosedaten. Mitarbeiter, die in diesem Aufgabenbereich tätig sind, benötigen WebSphere Message Broker-Berechtigungen. Für eine problemlose Arbeit mit WebSphere Message Broker sind außerdem einige sicherheitsspezifische Einstellungen notwendig. Darüber hinaus werden auch einige ganz typische Sicherheitseinstellungen vorgenommen, beispielsweise um Warteschlangen gegen unbefugte Zugriffe zu schützen.