In Eclipse integrierbare Bibliothekssteuersysteme wie IBM® Rational ClearCase lassen sich am besten in IBM Data Studio einbinden. Da IBM Data Studio jedoch alle zugehörigen Datendateien und Ordner in lokalen Dateisystemen speichert, können auch Bibliothekssteuersysteme, die sich nicht in Eclipse integrieren lassen, für die Verwaltung Ihrer Aufzeichnung der Datenbankänderungen verwendet werden. Sie können Änderungen als Versionen Ihres Datenentwurfsprojekts darstellen, die Sie in Ihr Bibliothekssteuersystem einchecken.