Il confronto che genera una markup redline in Rational DOORS viene eseguito in base alle parole tra due parti statiche
di testo. Viene utilizzato un algoritmo Longest Common Subsequence. Rational DOORS non salva le informazioni su singole sequenze di
tasti, quindi è possibile che la markup redline non rispecchi la sequenza di modifiche apportate dall'utente.
Se, ad esempio, Rational DOORS confronta ship wreck con shipwreck,
la markup redline mostra ship come eliminata, wreck come eliminata e
shipwreck come inserita.
Rational DOORS utilizza un'analisi a livello di parole anziché a livello di caratteri, per motivi di prestazioni.