L'accesso ai programmi IBM Rational ClearQuest dipende dalle impostazioni della variabile di ambiente specifica. Il metodo più affidabile per stabilire tali impostazioni è modificare lo script di avvio della shell.
È possibile aggiungere cquest–home–dir/bin alla variabile ambiente PATH per evitare di digitare il percorso completo quando si eseguono i comandi di Rational ClearQuest dalla shell.
Gli utenti di C shell impediscono l'inserimento delle impostazioni Rational ClearQuest nel file .login, eseguito solo dalle shell di accesso.