En la versión 2003.06.00 y posteriores, puede utilizar la API de Rational ClearQuest con CQperl.exe o ratlperl.exe. Si utiliza CQperl, se añaden implícitamente las vías de acceso de inclusión correctas a CQPerlExt.pm (el paquete Perl que proporciona la API de Rational ClearQuest). Si utiliza ratlperl en el sistema UNIX y en Linux, debe establecer la vía de acceso correcta.