Une fois toutes les personnalisations requises en place, la taxonomie peut être publiée. La fonctionnalité de publication permet de minimiser tout impact sur les recherches pendant l'importation, la personnalisation ou la mise à jour des données taxonomiques. Les systèmes d'informations et de référence sont censés être précis et il est par conséquent essentiel de s'assurer que les données renvoyées lors des recherches sont fiables et qu'elles ne sont pas affectées par les modifications apportées aux données taxonomiques.
Une fois publiés, les termes taxonomiques dans une version taxonomique sont disponibles pour indexation. La taxonomie doit être publiée non seulement après avoir été incorporée initialement dans la base de données, mais également après tout autre ajout à la taxonomie et mise à jour de cette dernière.