L'administration du système de messagerie sortante se divise en deux catégories principales : l'administration de site et l'administration de magasin. Un administrateur de site fournit la structure générale devant servir de base à tous les magasins du site, comme par exemple les types de transfert à utiliser. Par exemple, il est possible qu'un magasin n'utilise pas la messagerie électronique pour les transferts à moins qu'elle ait été préalablement configurée et mise en service par l'administrateur de site.